از آنجايي كه آموزش عالي اساس كار دانشگاه ها و موسسات آموزشي را تشكيل مي دهد ضرورت دارد تا ضوابط مقررات جاري آموزشي طوري به مرحله اجرا گذاشته شود تا ضمن بهبود در كميت ها، كيفيت آموزشي دانشجويان را ارتقاء‌ بخشد.بدين لحاظ، واحد زاهدان با فراهم كردن امكانات وسيع و گسترده و استفاده از سيستم انتخاب واحد اينترنتي توانسته است در جهت تسريع در امور آموزشي و تسهيل در انتخاب واحد دانشجويان گامهاي موثري بردارد.
واحد زاهدان با ايجاد فضاهاي مناسب آموزشي، كارگاهي و آزمايشگاهي زمينه ارتقاء كيفيت آموزشي و رشد و بالندگي جوانان و كليه طالبان علم و دانش را در استان پهناور سيستان و بلوچستان فراهم كرده است. آموزش دانشگاه آزاد اسلامي، كارشناسان و متصديان آموزشي كليه امور آموزشي را انجام مي دهد و به طور كلي تمامي برنامه ريزي هاي مربوط به آموزش كليه دانشجويان و دانشكده ها در حوزه معاونت آموزشي صورت مي گيرد.